MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 32722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012633	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
2	NC_012633	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
3	NC_012633	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
4	NC_012633	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	229586231
5	NC_012633	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586231
6	NC_012633	ATT	2	6	417	422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
7	NC_012633	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586231
8	NC_012633	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586231
9	NC_012633	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586231
10	NC_012633	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586231
11	NC_012633	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586231
12	NC_012633	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	229586231
13	NC_012633	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	229586231
14	NC_012633	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586231
15	NC_012633	ATT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012633	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012633	TTG	2	6	939	944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012633	ATA	2	6	1154	1159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586232
19	NC_012633	AAAGTA	2	12	1187	1198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	229586232
20	NC_012633	TGA	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586232
21	NC_012633	GTA	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586232
22	NC_012633	CAA	2	6	1313	1318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586232
23	NC_012633	A	7	7	1317	1323	100 %	0 %	0 %	0 %	229586232
24	NC_012633	TAA	2	6	1342	1347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586232
25	NC_012633	ATTT	2	8	1359	1366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012633	TCT	2	6	1462	1467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586233
27	NC_012633	A	6	6	1470	1475	100 %	0 %	0 %	0 %	229586233
28	NC_012633	TC	3	6	1480	1485	0 %	50 %	0 %	50 %	229586233
29	NC_012633	A	6	6	1540	1545	100 %	0 %	0 %	0 %	229586233
30	NC_012633	AT	3	6	1605	1610	50 %	50 %	0 %	0 %	229586233
31	NC_012633	TA	3	6	1723	1728	50 %	50 %	0 %	0 %	229586233
32	NC_012633	ATA	3	9	1726	1734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586233
33	NC_012633	A	7	7	1752	1758	100 %	0 %	0 %	0 %	229586233
34	NC_012633	GTA	2	6	1792	1797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586233
35	NC_012633	TGA	2	6	1892	1897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586233
36	NC_012633	GAA	2	6	1949	1954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586233
37	NC_012633	AAT	2	6	1979	1984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586233
38	NC_012633	AAG	2	6	1996	2001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586233
39	NC_012633	TTA	2	6	2034	2039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586233
40	NC_012633	CAA	3	9	2097	2105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586233
41	NC_012633	T	8	8	2129	2136	0 %	100 %	0 %	0 %	229586234
42	NC_012633	A	6	6	2139	2144	100 %	0 %	0 %	0 %	229586234
43	NC_012633	T	6	6	2204	2209	0 %	100 %	0 %	0 %	229586234
44	NC_012633	T	6	6	2264	2269	0 %	100 %	0 %	0 %	229586234
45	NC_012633	T	6	6	2273	2278	0 %	100 %	0 %	0 %	229586234
46	NC_012633	GA	3	6	2291	2296	50 %	0 %	50 %	0 %	229586234
47	NC_012633	CGG	2	6	2318	2323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586234
48	NC_012633	ATA	2	6	2394	2399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586234
49	NC_012633	A	7	7	2399	2405	100 %	0 %	0 %	0 %	229586234
50	NC_012633	T	7	7	2423	2429	0 %	100 %	0 %	0 %	229586234
51	NC_012633	TA	3	6	2455	2460	50 %	50 %	0 %	0 %	229586234
52	NC_012633	TTTTA	2	10	2495	2504	20 %	80 %	0 %	0 %	229586234
53	NC_012633	ATA	2	6	2532	2537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586234
54	NC_012633	TAA	2	6	2563	2568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586234
55	NC_012633	TG	3	6	2571	2576	0 %	50 %	50 %	0 %	229586234
56	NC_012633	TTAT	2	8	2656	2663	25 %	75 %	0 %	0 %	229586234
57	NC_012633	AT	3	6	2715	2720	50 %	50 %	0 %	0 %	229586234
58	NC_012633	ATG	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586234
59	NC_012633	TAT	2	6	2813	2818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586234
60	NC_012633	TTA	2	6	2827	2832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586234
61	NC_012633	ATTTA	2	10	2848	2857	40 %	60 %	0 %	0 %	229586234
62	NC_012633	TTAT	2	8	2878	2885	25 %	75 %	0 %	0 %	229586234
63	NC_012633	A	6	6	2942	2947	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
64	NC_012633	CTC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229586235
65	NC_012633	TC	3	6	3028	3033	0 %	50 %	0 %	50 %	229586235
66	NC_012633	ATT	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
67	NC_012633	ATT	2	6	3048	3053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
68	NC_012633	T	6	6	3091	3096	0 %	100 %	0 %	0 %	229586235
69	NC_012633	ATT	2	6	3161	3166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
70	NC_012633	A	7	7	3205	3211	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
71	NC_012633	A	6	6	3222	3227	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
72	NC_012633	AACT	2	8	3261	3268	50 %	25 %	0 %	25 %	229586235
73	NC_012633	CAAA	2	8	3307	3314	75 %	0 %	0 %	25 %	229586235
74	NC_012633	AGA	2	6	3334	3339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
75	NC_012633	AGA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
76	NC_012633	AGC	2	6	3364	3369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
77	NC_012633	TGC	2	6	3376	3381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586235
78	NC_012633	TG	3	6	3396	3401	0 %	50 %	50 %	0 %	229586235
79	NC_012633	A	7	7	3476	3482	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
80	NC_012633	A	7	7	3495	3501	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
81	NC_012633	GA	3	6	3503	3508	50 %	0 %	50 %	0 %	229586235
82	NC_012633	T	6	6	3532	3537	0 %	100 %	0 %	0 %	229586235
83	NC_012633	ATT	2	6	3567	3572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
84	NC_012633	TATT	2	8	3574	3581	25 %	75 %	0 %	0 %	229586235
85	NC_012633	GAG	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586235
86	NC_012633	TCGC	2	8	3704	3711	0 %	25 %	25 %	50 %	229586235
87	NC_012633	A	6	6	3747	3752	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
88	NC_012633	TAT	2	6	3805	3810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
89	NC_012633	GCA	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
90	NC_012633	AGA	2	6	3931	3936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
91	NC_012633	AT	3	6	3965	3970	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
92	NC_012633	CTA	2	6	4026	4031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586235
93	NC_012633	TAT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
94	NC_012633	TTA	2	6	4088	4093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
95	NC_012633	GGTCA	2	10	4095	4104	20 %	20 %	40 %	20 %	229586235
96	NC_012633	TGT	2	6	4108	4113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586235
97	NC_012633	AT	3	6	4275	4280	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
98	NC_012633	AG	3	6	4294	4299	50 %	0 %	50 %	0 %	229586235
99	NC_012633	ATA	2	6	4302	4307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
100	NC_012633	TA	3	6	4382	4387	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
101	NC_012633	GGC	2	6	4553	4558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586235
102	NC_012633	GCA	2	6	4577	4582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
103	NC_012633	A	6	6	4604	4609	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
104	NC_012633	TA	3	6	4634	4639	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
105	NC_012633	GGA	2	6	4654	4659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586235
106	NC_012633	GAA	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
107	NC_012633	AAG	2	6	4707	4712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
108	NC_012633	AAT	2	6	4718	4723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
109	NC_012633	GAA	2	6	4724	4729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
110	NC_012633	TAA	2	6	4744	4749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
111	NC_012633	TAAAT	2	10	4804	4813	60 %	40 %	0 %	0 %	229586235
112	NC_012633	GAG	2	6	4817	4822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229586235
113	NC_012633	AT	3	6	4826	4831	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
114	NC_012633	CAAAAC	2	12	5029	5040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586235
115	NC_012633	TCAAT	2	10	5074	5083	40 %	40 %	0 %	20 %	229586235
116	NC_012633	GTAGT	2	10	5130	5139	20 %	40 %	40 %	0 %	229586235
117	NC_012633	TAG	2	6	5152	5157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
118	NC_012633	AAG	2	6	5160	5165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
119	NC_012633	ACG	2	6	5169	5174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229586235
120	NC_012633	ATA	2	6	5196	5201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
121	NC_012633	ATT	2	6	5247	5252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
122	NC_012633	TAA	2	6	5269	5274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
123	NC_012633	AATA	2	8	5275	5282	75 %	25 %	0 %	0 %	229586235
124	NC_012633	GAT	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
125	NC_012633	ATTC	2	8	5312	5319	25 %	50 %	0 %	25 %	229586235
126	NC_012633	TGC	2	6	5326	5331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586235
127	NC_012633	T	6	6	5354	5359	0 %	100 %	0 %	0 %	229586235
128	NC_012633	ATT	2	6	5370	5375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
129	NC_012633	TGC	2	6	5383	5388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586235
130	NC_012633	TTAA	2	8	5444	5451	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
131	NC_012633	CTA	2	6	5478	5483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586235
132	NC_012633	AGT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
133	NC_012633	CGC	2	6	5541	5546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	229586235
134	NC_012633	A	7	7	5564	5570	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
135	NC_012633	TTG	2	6	5577	5582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586235
136	NC_012633	TTA	2	6	5606	5611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586235
137	NC_012633	ATA	2	6	5628	5633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
138	NC_012633	TAA	2	6	5697	5702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
139	NC_012633	ATA	2	6	5720	5725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
140	NC_012633	GAA	2	6	5726	5731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586235
141	NC_012633	A	6	6	5743	5748	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
142	NC_012633	ATA	2	6	5774	5779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586235
143	NC_012633	ATG	2	6	5807	5812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586235
144	NC_012633	AT	3	6	5860	5865	50 %	50 %	0 %	0 %	229586235
145	NC_012633	CAAAAT	2	12	5882	5893	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	229586235
146	NC_012633	A	6	6	5952	5957	100 %	0 %	0 %	0 %	229586235
147	NC_012633	TAATA	2	10	5990	5999	60 %	40 %	0 %	0 %	229586235
148	NC_012633	GTT	2	6	6019	6024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012633	T	7	7	6043	6049	0 %	100 %	0 %	0 %	229586236
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153	NC_012633	TAA	2	6	6132	6137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586236
154	NC_012633	GAT	2	6	6197	6202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586236
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158	NC_012633	T	8	8	6285	6292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012633	ATT	2	6	6299	6304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586237
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162	NC_012633	CTT	2	6	6398	6403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586237
163	NC_012633	GTT	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586237
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165	NC_012633	T	6	6	6467	6472	0 %	100 %	0 %	0 %	229586237
166	NC_012633	T	6	6	6504	6509	0 %	100 %	0 %	0 %	229586237
167	NC_012633	ATTT	2	8	6516	6523	25 %	75 %	0 %	0 %	229586237
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232	NC_012633	AAG	2	6	9386	9391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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241	NC_012633	TCG	2	6	9702	9707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
242	NC_012633	CGCTC	2	10	9743	9752	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
243	NC_012633	TTA	2	6	9813	9818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_012633	A	7	7	11044	11050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_012633	AAT	2	6	11077	11082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_012633	TAG	2	6	11102	11107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_012633	AGAAAA	2	12	11172	11183	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
268	NC_012633	TCT	2	6	11184	11189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
269	NC_012633	A	7	7	11190	11196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_012633	TAAA	2	8	11225	11232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_012633	TA	3	6	11254	11259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_012633	CAA	2	6	11260	11265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
273	NC_012633	CTT	2	6	11330	11335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586242
274	NC_012633	GAA	2	6	11347	11352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586242
275	NC_012633	T	7	7	11355	11361	0 %	100 %	0 %	0 %	229586242
276	NC_012633	TAAA	2	8	11390	11397	75 %	25 %	0 %	0 %	229586242
277	NC_012633	TAA	2	6	11436	11441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586242
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282	NC_012633	CTT	2	6	11563	11568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586242
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287	NC_012633	TAA	2	6	11899	11904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_012633	GTT	2	6	11920	11925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_012633	GAA	2	6	11938	11943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_012633	A	6	6	11992	11997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_012633	AG	3	6	12028	12033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
294	NC_012633	T	6	6	12040	12045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_012633	TCTT	2	8	12063	12070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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384	NC_012633	CAG	2	6	15713	15718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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388	NC_012633	AAGA	2	8	15842	15849	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
389	NC_012633	AGTA	2	8	15889	15896	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
390	NC_012633	ATTA	2	8	15914	15921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_012633	ATG	2	6	15936	15941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
392	NC_012633	AAG	2	6	15948	15953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_012633	CAA	2	6	16054	16059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
396	NC_012633	ATA	2	6	16063	16068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_012633	AT	3	6	16104	16109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_012633	ATA	2	6	16123	16128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_012633	TGAA	2	8	16151	16158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
400	NC_012633	ATA	2	6	16185	16190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_012633	TAAA	2	8	16194	16201	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_012633	GCA	2	6	16206	16211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
403	NC_012633	TAA	2	6	16213	16218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_012633	GCT	2	6	16230	16235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
405	NC_012633	AAT	2	6	16324	16329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_012633	TAA	2	6	16340	16345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_012633	GTA	2	6	16353	16358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
408	NC_012633	ATC	2	6	16368	16373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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